温暖な気候で水と緑に恵まれた島原市。海と鉄道、道路など古くから交通の要衝として知られています。
市内を移動する手段としては公共交通機関として路線バスや島原鉄道があります。
また、島原外港からは、熊本港（熊本県熊本市）と三池港（福岡県大牟田市）への航路があり、フェリーと高速船が就航しています。この航路を利用すると熊本や福岡へも気軽にアクセスすることができます。また、島原市内を通る幹線道路は島原半島を一周し、長崎・諫早方面へとつながっています。鉄道も充実しており島原外港駅を発着する島原鉄道は、諫早駅まで運行しています。